游離在細胞質基質中的核糖體合成的蛋白質（多肽）可能成為細胞質基質的“永久居民”，也可能運送到細胞核、線粒體、內質網等結構，其“命運”取決于自身的氨基酸序列中是否包含了分選信號序列以及是哪種分選信號序列，如圖所示：
（1）蛋白質可以穿過

核孔

核孔

進入細胞核，這種運輸方式

具有

具有

（具有、沒有）選擇透過性。
（2）線粒體所需的蛋白質

部分

部分

（全部、部分）來自細胞質基質，蛋白質進入線粒體多數需要位于其外膜上的TOM復合物和內膜上的TM23復合物的協助，據此推測TOM復合物和TM23復合物在功能上很可能相當于主動運輸所需的

載體蛋白

載體蛋白

。
（3）多肽在進入內質網之后需要繼續完成翻譯并進行

加工

加工

，研究發現，源于內質網的蛋白質其結構中并不包含分選信號序列，據此推測內質網中可能含有切除分選信號序列的

肽酶

肽酶

酶。
（4）內質網可以通過“出芽”形成

囊泡

囊泡

，包裹著蛋白質定向移動到高爾基體并與之融合，“出芽”和融合的基礎是生物膜具有

一定的流動性

一定的流動性

性。